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產(chǎn)品列表PRODUCTS LIST

實(shí)驗服務(wù) 高通量測序

簡(jiǎn)要描述:

服務(wù)說(shuō)明:
1、提供實(shí)驗材料,其必須保證新鮮,請您采樣后立即放入液氮中速凍或加入樣品穩定劑。
2、如果提供DNA,我們要對其進(jìn)行評估。基因組DNA無(wú)明顯降解,濃度≥500 ng/ul,總量
   大于30μg。
3、如果樣品可以用Trigol法提總RNA ,也可以將樣品研

更新時(shí)間:2024-06-12

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 產(chǎn)品選型:                                                                                                                             
高通量測序

 

服務(wù)編號服務(wù)項目收費標準(元)實(shí)驗周期
FZ32基因組de novo測序面議面議
FZ33基因組重測序面議面議
FZ34宏基因組測序面議面議
FZ35小RNA測序面議面議
FZ36真核生物轉錄組測序面議面議
FZ37簡(jiǎn)化基因組測序面議面議
FZ38細菌16S測序

產(chǎn)品介紹:
服務(wù)內容:
基因組de novo測序
1  基因組DNA提取
2  構建不同長(cháng)度的基因組文庫
3  上機測序
4  數據處理:去除接頭序列、污染序列等
5  基因組拼裝統計:原始數據統計、測序深度分析、覆蓋度統計、GC含量分析等;
6  基因組注釋?zhuān)夯蝾A測、基因功能注釋、重復序列分析、nocoding RNA注釋等;
7  基因功能分析 GO分析,KEGG通路分析等;
8  比較基因組學(xué)及進(jìn)化分析:物種系統發(fā)育樹(shù)構建、基因家族鑒定、基因共線(xiàn)性分析等。
 
基因組重測序
1  基因組DNA提取
2  構建基因組測序文庫
3  上機測序
4  數據處理:去除接頭序列、污染序列等
5  序列比對
6  SNP、 InDel、CNV、SV檢測等
 
宏基因組測序
1  基因組DNA提取
2  構建基因組測序文庫
3  上機測序
4  數據處理:去除接頭序列、污染序列等
5  宏基因組組裝:原始數據統計、測序深度分析、覆蓋度統計、GC含量分析等;
6  樣品復雜度分析:將測序所得Reads與業(yè)數據庫進(jìn)行比對統計;
7  物種分類(lèi):基因預測、相對豐度計算等;
 
真核生物轉錄組測序
1  RNA提取
2  構建測序文庫
3  上機測序
4   數據分析:
     無(wú)參考基因組的轉組分析
Ø 基本數據處理(圖像識別,堿基識別,測序街頭序列過(guò)濾,樣品污染可能性檢測)
Ø 測序數據產(chǎn)量統計,數據成分和質(zhì)量評估;
Ø Contig及Scaffold長(cháng)度分布;
Ø Unigene的長(cháng)度分布,GO分類(lèi),功能注釋?zhuān)x通路分析,表達差異分析。
有參考基因組的轉錄組分析
Ø 基本數據處理(圖像識別,堿基識別,測序街頭序列過(guò)濾,樣品污染可能性檢測);
Ø 與參考基因組比對后的注釋信息;
Ø 基因在基因組上的分布;
Ø 測序深度分布,測序隨機性評估,基因差異表達分析;
 
Small RNA測序
1  RNA提取
2  連接接頭及純化Samll RNA
3  上機測序
4  數據處理:去除接頭序列、污染序列等
5  樣品間的公共序列和特異序列的分析
6  Small RNA 與rRNA、tRNA、snRNA、snoRNA的比對信息
7  Small RNA 與重復序列的比對信息(需提供選定參考基因組對應的重復序列注釋信息);
8  Small RNA 與 miRBase 中范圍的已知的 miRNA 的比對;
9  按照優(yōu)先將 small RNA 進(jìn)行分類(lèi)注釋?zhuān)?nbsp;
10 利用Mireap 對沒(méi)有注釋的small RNA 進(jìn)行預測,預測新的 miRNA ;
11樣品間miRNA 差異分析(2個(gè)或2個(gè)以上樣品)和聚類(lèi)分析(3個(gè)或3個(gè)以上樣品) ;
12  MiRNA 靶基因預測(需要提供基因編碼序列);
 
簡(jiǎn)化基因組測序
1  基因組DNA提取 酶切 接接頭
2  上機測序
3  數據分析
 
未知參考基因組的信息分析流程
Ø 原始數據整理、過(guò)濾及質(zhì)量評估;
Ø 標記位點(diǎn)分析(標記位點(diǎn)鑒定,SNPs位點(diǎn)與InDel位點(diǎn)鑒定);
Ø 全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS);
Ø 連鎖分析和QTL定位;
Ø 種群進(jìn)化分析。
已知參考基因組的信息分析流程      
Ø 原始數據整理、過(guò)濾及質(zhì)量評估;
Ø 標記位點(diǎn)分析(標記位點(diǎn)鑒定,SNPs位點(diǎn)與InDel位點(diǎn)鑒定);
Ø SNP單體型圖譜分析;
Ø 全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS);
Ø 連鎖分析和QTL定位;
Ø 種群進(jìn)化分析。
 
細菌16S rDNA測序
 
1  基因組DNA提取 PCR擴增
2  上機測序
3  原始數據整理、過(guò)濾及質(zhì)量評估;
4  OTU列表生成及注釋?zhuān)?/span>
5  豐度分析(Alpha多樣性分析、物種豐度差異分析、聚類(lèi)分析);
6  群落結構分析(單樣品物種分布、 多樣品物種分布、含進(jìn)化關(guān)系的
物種分布、Beta多樣性分析)。
服務(wù)說(shuō)明:
1、提供實(shí)驗材料,其必須保證新鮮,請您采樣后立即放入液氮中速凍或加入樣品穩定劑。
2、如果提供DNA,我們要對其進(jìn)行評估。基因組DNA無(wú)明顯降解,濃度≥500 ng/ul,總量
   大于30μg。
3、如果樣品可以用Trigol法提總RNA ,也可以將樣品研磨后放在 Trigol中。
4、如果提供RNA,我們需要我們評估請提供濃度≥500 ng/ul,總量≥20 ug 的total RNA樣品
   樣品請去蛋白并進(jìn)DNase處理。
 

 

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